NUCLEOTIDE PROFILING

核苷酸谱

Nucleotide Profiling — Absolute Quantification

核苷酸(NTP / dNTP)是核酸合成的直接底物与能量代谢的核心载体,其池大小与平衡状态关系到细胞增殖、DNA 复制保真度与线粒体功能,也是抗代谢类药物的作用靶点。本服务对 25+ 个核苷酸及其脱氧形式进行绝对定量,适用于肿瘤代谢、细胞周期、线粒体 DNA 复制与抗病毒 / 抗肿瘤药物机制研究。

25+
个核苷酸目标分子
TARGET COMPOUNDS
2
形式:核糖 / 脱氧核糖核苷酸
NUCLEOTIDE FORMS
MRM
同位素内标绝对定量
ABSOLUTE QUANTIFICATION

检测列表与分析示例

Targeted List & Analysis Examples
靶向列表(部分)
NO.中文名称简称英文名称CAS 号
1脱氧腺苷三磷酸dATP2'-Deoxyadenosine5'-triphosphate1927-31-7
2脱氧鸟苷三磷酸dGTP2'-Deoxyguanosine5'-triphosphate2564-35-4
3脱氧胸腺嘧啶三磷酸dTTP2'-Deoxythymidinetriphosphate365-08-2
4肌苷-5'-三磷酸ITP2'-Inosine-5'-triphosphate132-06-9
5鸟苷-5'-三磷酸GTPGuanosine5'-triphosphate86-01-1
6尿苷-5'-磷酸UMPUridine5'-monophosphate58-97-9
7腺苷-5‘-三磷酸ATPAdenosinetriphosphate56-65-5
8胞苷一磷酸CMPCytidinemonophosphate63-37-6
完整清单请联系工作人员获取。

技术参数

TECHNICAL SPECIFICATIONS
检测平台超高效液相色谱-三重四极杆质谱(UHPLC-MS/MS)
离子模式正、负离子切换采集
定量单位标准曲线法定量,ng/mL 或 ng/g
质控方式队列插入 QC 样本,监控信号漂移与批次稳定性

样本要求与送样

SAMPLE REQUIREMENTS
血清 / 血浆
50 μL
组织
30 mg
细胞
1–5 × 10⁶ 个
粪便 / 肠内容物
100 mg 新鲜 / 20 mg 冻干
尿液
50 μL
外泌体
50 μL
生物学重复要求:细胞 / 微生物样本 ≥6 个重复/组;动物样本 ≥10 个重复/组;临床样本 ≥50 个重复/组并严格控制纳入标准。实验组与对照组的取材部位、时间与处理方式保持一致。
送样说明:适用血清 / 血浆、各类组织、粪便与肠内容物、尿液、唾液、细胞 / 细胞培养液等样本;推荐量为单次实验用量,实际送样建议为推荐量的 2–3 倍;组织样本请保证组间取材部位一致;干冰或冷链运输。

服务流程

WORKFLOW
1
需求沟通
研究目的 / panel 选择
2
方案报价
指标 / 周期 / 协议
3
样本接收
冷链 / 预检 / 编号
4
实验检测
仪器采集 / 质控
5
报告交付
定量表 + 解读 + 原始数据
分析交付:NTP / dNTP 池大小与比值分析 · 各代谢物绝对定量结果表(含量 + 单位)· 组间 T-test 差异分析与倍数变化 · PCA / PLS-DA 建模与层次聚类 · KEGG 注释与通路富集 · 完整分析报告与原始数据。

分析示例

ANALYSIS EXAMPLES
示例图基于真实项目数据生成,实际图表与分析内容以检测 panel 和项目方案为准。
T-test 柱状图
T-test 柱状图
按 p 值升序展示全部代谢物,横向分组柱形为两组均值 ± 标准差,p 值标注于柱右侧。
层次聚类热图
层次聚类热图
Z-score 归一化展示全部代谢物表达格局,代谢物行经层次聚类排序,红色高表达、蓝色低表达。
关联疾病条形图
关联疾病条形图
基于 HMDB 等数据库注释挖掘代谢物与疾病的已知关联,按关联代谢物数量排序。
代谢物表达含量分析
代谢物表达含量分析
分面箱线图呈现组间显著差异代谢物的含量分布,组间比较采用 Welch t-test。
柱状图分析
柱状图分析
差异代谢物逐样本含量柱状图,直观展示组间差异与个体离散程度。

参考文献

REFERENCES
[1] MULLEN N J, SINGH P K. Nucleotide metabolism: a pan-cancer metabolic dependency[J]. Nature Reviews Cancer, 2023, 23(5): 275-294.
[2] COHEN S, MEGHERBI M, JORDHEIM L P, et al. Simultaneous analysis of eight nucleoside triphosphates in cell lines by liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry[J]. Journal of Chromatography B, 2009, 877(30): 3831-3840.

应用场景

APPLICATIONS
核苷酸代谢与细胞增殖肿瘤代谢治疗靶点研究能量状态(ATP/ADP/AMP)评估核酸周转与合成研究免疫代谢研究

常见问题

FAQ
核苷酸谱的检测周期是多久?
成熟靶向 Panel 常规周期为 1–3 周,非靶向类项目为 2–4 周(自样本接收并质检合格起算)。具体周期在项目启动前以实验方案书面确认,全程可在 OmicsHub 云平台查看进度。
我的样本量达不到推荐量怎么办?
请先不要稀释样本。微量样本可通过调整前处理方法完成检测,把实际样本量告知我们,技术团队会评估可行性并在方案中注明调整口径。
可以在现有列表基础上增加目标物质吗?
可以。成熟 Panel 支持按需增加物质;列表外的新物质可通过定制方法开发实现(需标准品与额外的方法学验证周期),详见"常用定制类靶向物质"服务。
核苷酸谱对样本有什么要求?怎么收集?
血清/血浆 ≥100 μL(空腹、避免溶血)、组织 ≥50 mg(离体后液氮速冻)、细胞 ≥1×10⁶(PBS 洗净培养基)、尿液 ≥200 μL。统一空腹时间、单次用量分装、避免反复冻融是关键。完整采集与处理指引见《技术资源 → 样本相关》。

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