实验流程
多组学实验涵盖样本处理、文库构建、上机检测、数据质控四大核心环节
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- 核对样本编号、名称、数量是否与委托单一致
- 检查干冰剩余量(应 ≥ 原量 50%)
- 观察样本是否完全冻存(避免半融状态)
- 拍照留档,系统登记入库时间
- 将样本转移至 -80℃ 冰箱指定位置
01整体实验流程概览
多组学实验涵盖样本处理、文库构建、上机检测、数据质控四大核心环节
样本接收
干冰签收、样本登记、外观核查
样本 QC
浓度测定、完整性评估、质控报告
样本分装
按组学类型分装、标记、入库冻存
文库构建
RNA / DNA / 蛋白 / 代谢物提取
文库质控
片段分布、浓度精确定量
上机测序 / 质谱
Illumina / PacBio / Orbitrap / timsTOF
实时 QC
上机过程中实时监控数据质量
数据交付
原始数据、分析结果、报告文档
售后支持
数据解读、文章投稿技术支持
02详细操作流程
第一步 | 样本接收与登记
收到样本后,技术员在 30 分钟内完成以下操作:
- 核对样本编号、名称、数量是否与委托单一致
- 检查干冰剩余量(应 ≥ 原量 50%)
- 观察样本是否完全冻存(避免半融状态)
- 拍照留档,系统登记入库时间
- 将样本转移至 -80℃ 冰箱指定位置
第二步 | 样本质量检测(QC)
不同组学对样本质量的要求不同,所有样本必须经过 QC 合格后方可进入下一级实验:
- 基因组 / 表观组:Nanodrop 测定 A260/280(1.8–2.0),Agilent Tapestation 检测 DNA 完整性
- 转录组:Agilent Bioanalyzer 测定 RIN 值(要求 ≥ 7.0)
- 蛋白质组:BCA 法测定蛋白浓度,1D SDS-PAGE 检测降解
- 代谢组:目测样本状态,记录溶血/脂血情况
QC 不合格样本将立即通知客户,协商解决方案(补寄 / 调整实验方案)。
第三步 | 核酸 / 蛋白 / 代谢物提取
根据组学类型选择合适的提取试剂盒和实验方案:
- DNA 提取:Qiagen DNeasy / MagAttract 磁珠法(高通量)
- RNA 提取:Qiagen RNeasy / Norgen 体液 RNA 提取 kit
- 蛋白提取:SDT 裂解液 / 尿素裂解液,超声破碎
- 代谢物提取:预冷甲醇:乙腈:水(2:2:1)沉淀蛋白法
提取后再次测定浓度和完整性,确保进入文库构建环节的样本质量达标。
第四步 | 文库构建(测序样本)
针对不同测序类型,采用相应的文库构建方案:
- WGS 文库:Illumina TruSeq DNA PCR-Free 或 Nextera Flex
- RNA-seq 文库:Illumina TruSeq Stranded mRNA / Illumina Stranded Total RNA
- scRNA-seq 文库:10x Genomics Chromium 平台
- ATAC-seq 文库:Transposase 转座酶 tagmentation 方案
文库构建完成后,使用 Agilent Tapestation / Bioanalyzer 检测片段分布,Qubit 精确定量,合格文库进入 Pooling 环节。
第五步 | 上机测序 / 质谱检测
根据实验设计选择的平台进行数据采集:
- Illumina NGS:NovaSeq X Plus / NovaSeq 6000,PE150 模式
- PacBio TGS:Revio 系统,HiFi 模式
- LC-MS/MS(蛋白):Thermo Orbitrap Astral / timsTOF HT,DIA 模式
- LC-MS/MS(代谢):Thermo QE HF-X / ZenoTOF 7600,非靶向 + 靶向
上机过程中实时监测:测序 Q30 比例、质谱 MS1/MS2 分辨率、保留时间稳定性等指标。
第六步 | 数据分析与报告撰写
原始数据经过标准生信流程分析,最终交付:
- 原始数据文件(FASTQ / RAW / WIFF)
- 标准分析报告(PDF + 可编辑图表)
- 发表级矢量图源文件(AI / SVG)
- OmicsHub 云平台交互式分析报告
03各环节质控标准
在每个关键环节均设有严格的质控标准,确保最终数据质量
基因组学 QC
A260/280: 1.8–2.0
DNA 完整性:无明显的降解条带;没有蛋白 / RNA 污染;测序 Q30 ≥ 85%。
转录组学 QC
RIN ≥ 7.0
28S/18S ≥ 1.5;RNA 浓度 ≥ 500 ng(WTS);测序 Q30 ≥ 90%;比对率 ≥ 70%。
蛋白质组学 QC
蛋白 ≥ 0.5 μg/μL
1D 胶无降解条带;MS 分辨率 ≥ 120,000(Orbitrap);鉴定蛋白数 ≥ 目标值。
代谢组学 QC
QC 样本 RSD < 15%
QC 混合池连续进样,代谢物峰面积 RSD < 15%;保留时间偏移 < 1 秒。
04实验周期参考
标准流程周期
- 基因组学(WGS):约 15–20 工作日
- 转录组学(RNA-seq):约 13–17 工作日
- 蛋白质组学(DIA):约 15–20 工作日
- 代谢组学(LC-MS):约 15–20 工作日
- 多组学整合分析:约 20–30 工作日(视数据复杂度而定)
加急服务
- 优先上机:支付加急费后可插队提前上机,周期缩短 30–50%
- 并行分析:多个组学同时提取、同时上机,大幅缩短总周期
- 快速分析:标准分析可在 3 个工作日内完成(需提前预约)
- 预决算:提供项目周期预决算服务,明确各节点完成时间
- 加急服务详情请咨询技术支持

