NUCLEOSIDE PROFILING

核苷谱

Nucleoside Profiling — Absolute Quantification

核苷是核酸水解与 RNA 周转的产物,修饰核苷(如假尿苷、甲基化核苷)随 RNA 代谢速率改变释放入血与尿液,长期被作为肿瘤负荷与疗效监测的潜在标志物。本服务对 15 个核苷及修饰核苷进行绝对定量,适用于核酸代谢、RNA 修饰与肿瘤标志物研究。

15
个核苷目标分子
TARGET COMPOUNDS
2
类:常规核苷 / 修饰核苷
NUCLEOSIDE CLASSES
MRM
同位素内标绝对定量
ABSOLUTE QUANTIFICATION

检测列表与分析示例

Targeted List & Analysis Examples
靶向列表(部分)
NO.中文名称英文名称CAS 号
1AdenosineAdenosine58-61-7
2InosineInosine58-63-9
3PseudouridinePseudouridine1445-07-4
4XanthosineXanthosine146-80-5
5CytidineCytidine65-46-3
6UridineUridine58-96-8
7GuanosineGuanosine118-00-3
8HypoxanthineHypoxanthine68-94-0
完整清单请联系工作人员获取。

技术参数

TECHNICAL SPECIFICATIONS
检测平台超高效液相色谱-三重四极杆质谱(UHPLC-MS/MS)
离子模式正、负离子切换采集
定量单位标准曲线法定量,ng/mL 或 ng/g
质控方式队列插入 QC 样本,监控信号漂移与批次稳定性

样本要求与送样

SAMPLE REQUIREMENTS
血清 / 血浆
50 μL
组织
30 mg
细胞
1–5 × 10⁶ 个
粪便 / 肠内容物
100 mg 新鲜 / 20 mg 冻干
尿液
50 μL
外泌体
50 μL
生物学重复要求:细胞 / 微生物样本 ≥6 个重复/组;动物样本 ≥10 个重复/组;临床样本 ≥50 个重复/组并严格控制纳入标准。实验组与对照组的取材部位、时间与处理方式保持一致。
送样说明:适用血清 / 血浆、各类组织、粪便与肠内容物、尿液、唾液、细胞 / 细胞培养液等样本;推荐量为单次实验用量,实际送样建议为推荐量的 2–3 倍;组织样本请保证组间取材部位一致;干冰或冷链运输。

服务流程

WORKFLOW
1
需求沟通
研究目的 / panel 选择
2
方案报价
指标 / 周期 / 协议
3
样本接收
冷链 / 预检 / 编号
4
实验检测
仪器采集 / 质控
5
报告交付
定量表 + 解读 + 原始数据
分析交付:修饰核苷占比与组间差异统计 · 各代谢物绝对定量结果表(含量 + 单位)· 组间 T-test 差异分析与倍数变化 · PCA / PLS-DA 建模与层次聚类 · KEGG 注释与通路富集 · 完整分析报告与原始数据。

分析示例

ANALYSIS EXAMPLES
示例图基于真实项目数据生成,实际图表与分析内容以检测 panel 和项目方案为准。
T-test 柱状图
T-test 柱状图
按 p 值升序展示全部代谢物,横向分组柱形为两组均值 ± 标准差,p 值标注于柱右侧。
层次聚类热图
层次聚类热图
Z-score 归一化展示全部代谢物表达格局,代谢物行经层次聚类排序,红色高表达、蓝色低表达。
关联疾病条形图
关联疾病条形图
基于 HMDB 等数据库注释挖掘代谢物与疾病的已知关联,按关联代谢物数量排序。
代谢物表达含量分析
代谢物表达含量分析
分面箱线图呈现组间显著差异代谢物的含量分布,组间比较采用 Welch t-test。
柱状图分析
柱状图分析
差异代谢物逐样本含量柱状图,直观展示组间差异与个体离散程度。

参考文献

REFERENCES
[1] SEIDEL A, BRUNNER S, SEIDEL P, et al. Modified nucleosides: an accurate tumour marker for clinical diagnosis of cancer, early detection and therapy control[J]. British Journal of Cancer, 2006, 94(11): 1726-1733.
[2] STRUCK W, SILUK D, YUMBA-MPANGA A, et al. Liquid chromatography tandem mass spectrometry study of urinary nucleosides as potential cancer markers[J]. Journal of Chromatography A, 2013, 1283: 122-131.

应用场景

APPLICATIONS
核苷代谢与修饰研究肿瘤核苷代谢靶向中药核苷类成分评价微生物代谢研究抗病毒药物机制研究

常见问题

FAQ
核苷谱的检测周期是多久?
成熟靶向 Panel 常规周期为 1–3 周,非靶向类项目为 2–4 周(自样本接收并质检合格起算)。具体周期在项目启动前以实验方案书面确认,全程可在 OmicsHub 云平台查看进度。
我的样本量达不到推荐量怎么办?
请先不要稀释样本。微量样本可通过调整前处理方法完成检测,把实际样本量告知我们,技术团队会评估可行性并在方案中注明调整口径。
可以在现有列表基础上增加目标物质吗?
可以。成熟 Panel 支持按需增加物质;列表外的新物质可通过定制方法开发实现(需标准品与额外的方法学验证周期),详见"常用定制类靶向物质"服务。
核苷谱对样本有什么要求?怎么收集?
血清/血浆 ≥100 μL(空腹、避免溶血)、组织 ≥50 mg(离体后液氮速冻)、细胞 ≥1×10⁶(PBS 洗净培养基)、尿液 ≥200 μL。统一空腹时间、单次用量分装、避免反复冻融是关键。完整采集与处理指引见《技术资源 → 样本相关》。

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