--- title: "真核转录组测序" lang: zh url: https://www.gereallife.com/zh/services/rna-seq.html canonical: https://www.gereallife.com/zh/services/rna-seq.html entity: Shanghai Gereallife Biotech Co., Ltd updated: 2026-11-02 --- TRANSCRIPTOMICS # 真核转录组测序 Eukaryotic Transcriptome Sequencing — Expression & Differential Analysis 真核转录组测序（RNA-Seq）对样本中的 mRNA 表达进行全景检测：总 RNA 经 Oligo(dT) 磁珠富集 mRNA 并建库测序，数据质控后由 STAR 比对参考基因组，完成基因 / 转录本水平表达定量；在此基础上开展差异表达、GO / KEGG 富集与 GSEA 分析。 Oligo(dT) mRNA 富集建库 mRNA ENRICHMENT STAR 参考基因组比对 REFERENCE ALIGNMENT 8 个分析模块 ANALYSIS MODULES ## 技术参数 TECHNICAL SPECIFICATIONS | 项目 | 内容 | | --- | --- | | 建库方式 | Oligo(dT) 磁珠富集 mRNA 建库 | | 序列比对 | STAR 将优化数据比对至参考基因组；从比对效率、片段长度、覆盖均一度评估测序与建库质量 | | 表达定量 | 按注释文件定量基因 / 转录本表达，输出 Count、FPKM、TPM、log2TPM 多口径表达量 | | 差异分析阈值 | read count 标准化（测序深度校正）→ 统计模型计算 P value → BH 校正得到 padj；默认 |log2(FoldChange)| > 1 且 padj < 0.05 | | 常规交付 | 原始数据 + 分析报告 | ## 分析流程 ANALYSIS WORKFLOW 1 数据质控 接头剪切 · rRNA 评估 2 序列比对 STAR · 参考基因组 3 表达定量 Count / FPKM / TPM 4 表达质控 相关性 · PCA 5 差异分析 火山图 · 聚类图 6 GO 富集 BP / CC / MF 7 KEGG 富集 通路 · 气泡图 8 GSEA 分析 GO / KEGG 基因集 ## 生信分析内容 BIOINFORMATIC MODULES | 分析模块 | 核心方法与指标 | 主要产出图表 | | --- | --- | --- | | 测序数据统计 | 原始数据 fastq（R1 / R2）碱基质量与含量分布；剪切 3′ / 5′ 端 adapter，过滤平均质量值 < 20 与长度 < 50 bp 的 reads，剔除含 N reads；评估 rRNA 污染率 | 原始数据与优化数据统计表、碱基质量与含量分布图 | | 比对质控 | STAR 将优化数据比对至参考基因组；从比对效率、片段长度、覆盖均一度等把控点评估测序与建库质量 | 比对效率统计表、样本比对详情图 | | mRNA 定量 | 按注释文件定量基因 / 转录本表达，输出 Count、FPKM、TPM、log2TPM 多口径表达量；统计高表达转录本 Top10 | 表达量矩阵、Top10 表达量表 | | 表达分布与质控 | 表达量密度分布；样本表达量小提琴图 / 箱型图；样本间 Pearson 相关性热图（组内重复理想 R² > 0.9）与 PCA 降维 | 密度分布图、小提琴 / 箱型图、相关性热图、PCA 图 | | 差异分析 | read count 标准化（测序深度校正）→ 统计模型计算 P value → BH 多重假设检验校正得到 padj；默认 |log2(FoldChange)| > 1 且 padj < 0.05 | 差异分析结果表、火山图 | | 差异表达模式 | 差异基因表达模式聚类；多比较组间共有与特有差异基因统计 | 表达模式聚类热图、组间共有差异基因图 | | GO 功能富集 | 差异基因 GO 富集（BP / CC / MF），输出 GeneRatio / BgRatio、富集因子与校正 p 值 | GO 富集气泡图与柱状图 | | KEGG 与 GSEA | 差异基因 KEGG 通路富集；分别基于 GO 与 KEGG 的 GSEA 分析，输出富集打分 ES、标准化打分 NES 与校正 p 值 | KEGG 富集图、GSEA 富集图与点状图 | ## 示例结果图 SELECTED FIGURES FROM ACTUAL REPORTS 基因表达量密度分布 各样本 log2(TPM) 表达量密度曲线，评估样本表达分布一致性。 表达量小提琴图 / 箱型图 各样本基因表达值的分布与概率密度，箱体为中位数与四分位数。 样本间相关性热图 样本两两 Pearson 相关系数与层次聚类，评估生物学重复一致性。 样本间 PCA 分析 表达量降维后的样本分布，展示组间分离与组内聚集情况。 差异表达火山图 log2(FoldChange) 与 −log10(P) 双阈值标注上调 / 下调基因，并标注关键基因。 差异基因表达模式聚类图 差异基因在各样本中的表达模式（log10 TPM），含基因与样本双向聚类。 GO 功能富集分析（节选） 差异基因 GO 条目（BP / CC / MF）富集结果与显著性，节选 Top 条目。 基于 GO 的 GSEA 富集图 富集打分曲线与排序基因位置，标注 NES 与校正 p 值。 基于 KEGG 的 GSEA 点状图 KEGG 通路富集基因比例与显著性，点大小表示富集基因数。 ## 常见问题 FAQ 真核转录组测序项目周期多久？ 自样本质检合格起，常规周期为 3–6 周（含建库、测序与生信分析）；样本量大或深度定制分析的项目以方案确认为准。 样本质量不合格怎么办？ 样本质检不合格会第一时间出具质检报告并说明原因，与您协商重新送样或调整方案，不会强行上机。 生信分析包含哪些内容？可以追加个性化分析吗？ 标准交付已覆盖质控、比对 / 组装、定量、差异与功能富集等核心模块；在此基础上支持个性化深度分析与多组学联合分析，按需求评估报价。 真核转录组测序对样本有什么要求？ 总 RNA ≥1 μg 且 RIN ≥7（液氮速冻、干冰运输）；微生物与粪便样本 ≥200 mg（无菌采集、−80 ℃）；全血 WGS ≥500 μL（EDTA 抗凝，禁用肝素）。RNA 完整性优先于浓度。详见 《 技术资源 → 样本相关 》 。 ## 相关服务 RELATED SERVICES ### 16S/18S/ITS扩增子测序 Amplicon Sequencing ### 宏基因组测序 Metagenomics ### 全基因组测序 Whole Genome Sequencing ## 获取方案与报价 填写需求，1 个工作日内回复（免费方案评估） 称呼 单位 手机或微信 需求方向 样本类型、数量与检测目标（可选） 提交需求 仅用于本次咨询，不会对外共享。 ## 开启您的多组学研究 免费方案设计 · 实验全程互动 · 数据深度解读 服务热线 / HOTLINE 400-660-8826 商务邮箱 / EMAIL market@gereallife.com 官方渠道 OFFICIAL CHANNELS 微信公众号 WECHAT OFFICIAL ACCOUNT 客服微信 CUSTOMER SERVICE 小红书 XIAOHONGSHU 电话咨询： 400-660-8826 微信扫码咨询