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title: "实验流程"
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entity: Shanghai Gereallife Biotech Co., Ltd
updated: 2026-11-02
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本文要点 
 
- 核对样本编号、名称、数量是否与委托单一致
- 检查干冰剩余量（应 ≥ 原量 50%）
- 观察样本是否完全冻存（避免半融状态）
- 拍照留档，系统登记入库时间
- 将样本转移至 -80℃ 冰箱指定位置 
 
 
 

## 01整体实验流程概览

 

多组学实验涵盖样本处理、文库构建、上机检测、数据质控四大核心环节

### 样本接收

干冰签收、样本登记、外观核查

### 样本 QC

浓度测定、完整性评估、质控报告

### 样本分装

按组学类型分装、标记、入库冻存

### 文库构建

RNA / DNA / 蛋白 / 代谢物提取

### 文库质控

片段分布、浓度精确定量

### 上机测序 / 质谱

Illumina / PacBio / Orbitrap / timsTOF

### 实时 QC

上机过程中实时监控数据质量

### 数据交付

原始数据、分析结果、报告文档

### 售后支持

数据解读、文章投稿技术支持

 
 
 

## 02详细操作流程

 

### 第一步 | 样本接收与登记

收到样本后，技术员在 30 分钟内 完成以下操作：

 
- 核对样本编号、名称、数量是否与委托单一致
- 检查干冰剩余量（应 ≥ 原量 50%）
- 观察样本是否完全冻存（避免半融状态）
- 拍照留档，系统登记入库时间
- 将样本转移至 -80℃ 冰箱指定位置 

### 第二步 | 样本质量检测（QC）

不同组学对样本质量的要求不同，所有样本 必须经过 QC 合格 后方可进入下一级实验：

 
- 基因组 / 表观组： Nanodrop 测定 A260/280（1.8–2.0），Agilent Tapestation 检测 DNA 完整性
- 转录组： Agilent Bioanalyzer 测定 RIN 值（要求 ≥ 7.0）
- 蛋白质组： BCA 法测定蛋白浓度，1D SDS-PAGE 检测降解
- 代谢组： 目测样本状态，记录溶血/脂血情况 

QC 不合格样本将立即通知客户，协商解决方案（补寄 / 调整实验方案）。

### 第三步 | 核酸 / 蛋白 / 代谢物提取

根据组学类型选择合适的提取试剂盒和实验方案：

 
- DNA 提取： Qiagen DNeasy / MagAttract 磁珠法（高通量）
- RNA 提取： Qiagen RNeasy / Norgen 体液 RNA 提取 kit
- 蛋白提取： SDT 裂解液 / 尿素裂解液，超声破碎
- 代谢物提取： 预冷甲醇:乙腈:水（2:2:1）沉淀蛋白法 

提取后再次测定浓度和完整性，确保进入文库构建环节的样本质量达标。

### 第四步 | 文库构建（测序样本）

针对不同测序类型，采用相应的文库构建方案：

 
- WGS 文库： Illumina TruSeq DNA PCR-Free 或 Nextera Flex
- RNA-seq 文库： Illumina TruSeq Stranded mRNA / Illumina Stranded Total RNA
- scRNA-seq 文库： 10x Genomics Chromium 平台
- ATAC-seq 文库： Transposase 转座酶 tagmentation 方案 

文库构建完成后，使用 Agilent Tapestation / Bioanalyzer 检测片段分布，Qubit 精确定量，合格文库进入 Pooling 环节。

### 第五步 | 上机测序 / 质谱检测

根据实验设计选择的平台进行数据采集：

 
- Illumina NGS： NovaSeq X Plus / NovaSeq 6000，PE150 模式
- PacBio TGS： Revio 系统，HiFi 模式
- LC-MS/MS（蛋白）： Thermo Orbitrap Astral / timsTOF HT，DIA 模式
- LC-MS/MS（代谢）： Thermo QE HF-X / ZenoTOF 7600，非靶向 + 靶向 

上机过程中实时监测：测序 Q30 比例、质谱 MS1/MS2 分辨率、保留时间稳定性等指标。

### 第六步 | 数据分析与报告撰写

原始数据经过标准生信流程分析，最终交付：

 
- 原始数据文件（FASTQ / RAW / WIFF）
- 标准分析报告（PDF + 可编辑图表）
- 发表级矢量图源文件（AI / SVG）
- OmicsHub 云平台交互式分析报告 
 
 
 

## 03各环节质控标准

 

在每个关键环节均设有严格的质控标准，确保最终数据质量

### 基因组学 QC

A260/280: 1.8–2.0

DNA 完整性：无明显的降解条带；没有蛋白 / RNA 污染；测序 Q30 ≥ 85%。

### 转录组学 QC

RIN ≥ 7.0

28S/18S ≥ 1.5；RNA 浓度 ≥ 500 ng（WTS）；测序 Q30 ≥ 90%；比对率 ≥ 70%。

### 蛋白质组学 QC

蛋白 ≥ 0.5 μg/μL

1D 胶无降解条带；MS 分辨率 ≥ 120,000（Orbitrap）；鉴定蛋白数 ≥ 目标值。

### 代谢组学 QC

QC 样本 RSD 
 
 

## 04实验周期参考

 

### 标准流程周期

 
- 基因组学（WGS）： 约 15–20 工作日
- 转录组学（RNA-seq）： 约 13–17 工作日
- 蛋白质组学（DIA）： 约 15–20 工作日
- 代谢组学（LC-MS）： 约 15–20 工作日
- 多组学整合分析： 约 20–30 工作日 （视数据复杂度而定） 

### 加急服务

 
- 优先上机： 支付加急费后可插队提前上机，周期缩短 30–50%
- 并行分析： 多个组学同时提取、同时上机，大幅缩短总周期
- 快速分析： 标准分析可在 3 个工作日内完成（需提前预约）
- 预决算： 提供项目周期预决算服务，明确各节点完成时间
- 加急服务详情请咨询技术支持 
 
 
 

## Q&A常见问题

 样本寄到你们那边，第一步做什么？ 技术员会在 30 分钟内完成接收：核对样本编号、名称和数量是否与委托单一致，确认样本完全冻存，拍照留档并登记入库时间，随后转移至 -80℃ 冰箱。 
 干冰到货只剩一半，样本还能用吗？ 收货时会检查干冰剩余量，应不低于原量的 50%；同时要确认样本完全冻存、没有半融状态。 
 RNA 样本 RIN 值多少才算合格？ 转录组样本用 Agilent Bioanalyzer 测 RIN 值，要求 ≥ 7.0；另外还要求 28S/18S ≥ 1.5、RNA 浓度 ≥ 500 ng（WTS）。 
 样本 QC 没通过会怎么处理？ 所有样本必须 QC 合格才能进入下一级实验；不合格会立即通知客户，协商补寄或调整实验方案。 
 从寄样到拿到数据要多久？ WGS 约 15–20 工作日，RNA-seq 约 13–17 工作日，蛋白质组（DIA）与代谢组（LC-MS）约 15–20 工作日，多组学整合约 20–30 工作日。 
 
 
 
 
 
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