--- title: "上机检测" lang: zh url: https://www.gereallife.com/zh/services/resources-instrument.html canonical: https://www.gereallife.com/zh/services/resources-instrument.html entity: Shanghai Gereallife Biotech Co., Ltd updated: 2026-11-02 --- 本文要点 - PE150 模式，读长最高 2×300 bp - 单 flow cell 产出最高 25 B reads - Q30 比例 ≥ 85%（WGS） - 支持 WGS/WES/RNA-seq/scRNA-seq ## 01测序上机平台 覆盖二代测序（NGS）与三代测序（TGS），满足从短读长到长读长、从 bulk 到单细胞的全场景需求 ### Illumina NGS 平台 短读长 · 高通量 · 高精度 ### 仪器型号 Illumina NovaSeq X Plus / NovaSeq 6000 / NextSeq 2000 ### 技术特点 - PE150 模式，读长最高 2×300 bp - 单 flow cell 产出最高 25 B reads - Q30 比例 ≥ 85%（WGS） - 支持 WGS/WES/RNA-seq/scRNA-seq ### 适用组学 基因组学（WGS/WES）、转录组学（RNA-seq）、单细胞测序 ### PacBio TGS 平台 长读长 · HiFi 高精度 · 甲基化直接测序 ### 仪器型号 PacBio Revio / Sequel IIe ### 技术特点 - HiFi 读长：平均 15–25 kb，精度 >99.9% - 单次运行产出最高 90 Gb HiFi 数据 - 可直接检测 DNA 甲基化（5mC） - 适合复杂基因组组装、结构变异检测 ### 适用组学 全基因组测序（大型基因组）、全长转录本测序、甲基化测序 ### Oxford Nanopore 平台 超长读长 · 实时测序 · 直接甲基化检测 ### 仪器型号 Oxford Nanopore PromethION 24 / MinION Mk1C ### 技术特点 - 超长读长：平均 30–50 kb，最长 >1 Mb - 无需 PCR，直接测序，减少偏好性 - 实时数据产出，可边测序边分析 - 适合宏基因组、病毒组装、结构变异 ### 适用组学 宏基因组测序、大型基因组组装、病毒多样性研究 ## 02质谱上机平台 配备 Thermo Fisher 和 Bruker 顶级质谱系统，覆盖蛋白质组学与代谢组学的高精度检测需求 ### Thermo Orbitrap Astral 超高扫描速度 · 高灵敏度 · 4D 蛋白组学 ### 技术特点 - 扫描速度：高达 200 Hz（Astral 质量分析器） - 分辨率：Orbitrap 最高 480,000 FWHM - 单次 DIA 运行可鉴定 >12,000 个蛋白 - 动态范围：> 5 个数量级 ### 适用应用 4D 蛋白质组学（DIA/DDA/PRM）、翻译后修饰分析、大队列临床研究 ### Bruker timsTOF HT 离子淌度分离 · PASEF 技术 · 超高灵敏度 ### 技术特点 - 淌度分辨率：最高 300–500 1/K0 - PASEF 模式离子利用率提升 10–20 倍 - 扫描速度：高达 100 Hz MS/MS - 适合超低上样量（ ### 适用应用 微量样本蛋白质组学、单细胞蛋白质组学、血浆深度蛋白质组学 ### Thermo Q Exactive HF-X 高分辨 · 高精准质量数 · 代谢组/蛋白组通用 ### 技术特点 - 分辨率：最高 240,000 FWHM（@ m/z 200） - 质量精度： 4 个数量级 - 同时支持 DDA / DIA / PRM 采集模式 ### 适用应用 代谢组学（LC-MS/MS 非靶向 + 靶向）、蛋白质组学（DIA/DDA）、修饰分析 ## 03标准上机流程 从文库/样品上机到数据产出的标准化操作流程 ### 上机准备 文库/样品质控复核、上机芯片/色谱柱准备 ### Pool 与加载 多篇文库按等摩尔比例混合、稀释、加载至 flow cell ### 测序/采集 按预设方案运行，实时监控 Q30/分辨率等指标 ### 实时 QC 每 12–24h 检查一次数据质量，必要时调整参数 ### 数据产出 原始数据（FASTQ/RAW/WiFF）传输至存储服务器 ## 04各平台核心参数对比 | 平台 | 读长/分辨率 | 通量（每运行） | 精度 / 质量精度 | 运行周期 | | --- | --- | --- | --- | --- | | Illumina NovaSeq X Plus | PE 2×150 bp | 最高 25 B reads | Q30 ≥ 85% | 约 24–48 h | | PacBio Revio | HiFi 15–25 kb | 最高 90 Gb | 精度 > 99.9% | 约 24 h | | Nanopore PromethION | 超长读长 30–50 kb | 最高 150 Gb | 精度 ~98%（HAC 模型） | 实时（可中断） | | Orbitrap Astral | 分辨率 480,000 | ~200 Hz 扫描速度 | 质量精度 ## 05上机过程质控监控 上机过程中实时监控关键指标，确保数据质量符合交付标准 ### 测序 QC 指标 Q30 ≥ 85% NGS 数据 Q30（错误率 ≤ 0.1%）比例，低于 80% 将触发预警并评估是否重测。 - 测序均一性： 各样本覆盖率 CV ### 质谱 QC 指标 MS1 分辨率 ≥ 60,000 蛋白质组 DIA 采集时，MS1 分辨率需 ≥ 60,000；代谢组 MS1 分辨率 ≥ 35,000。 - 保留时间漂移： 批次内 8,000 蛋白 ### 预警与处理机制 实时监控 · 快速响应 上机过程中每 12 小时生成一次 QC 报告，技术员根据以下规则处理： - 黄色预警： Q30 下降 3% 以内，继续运行并加强监控 - 橙色预警： Q30 20%，暂停评估 - 红色预警： 严重偏离，终止运行，排查原因后重测 ## 06上机前注意事项 ### 测序样本上机前检查清单 - 文库浓度 ≥ 2 nM（Illumina 标准），稀释至工作浓度时使用 EB 缓冲液 - 文库片段分布符合预期（Agilent TapeStation 检测），无明显接头二聚体峰 - Pool 中各文库等摩尔比混合，避免某些样本被过度代表 - Clustering 效率预测：预计每个样本产出 reads 数符合实验设计 - Flow cell 型号与文库类型匹配（NovaSeq X Plus 使用 X 系列 flow cell） ### 质谱样本上机前检查清单 - 蛋白/代谢物提取液已完全去除宿主蛋白/盐离子（LCMS 级纯水/乙腈清洗管路） - 色谱柱已平衡 ≥ 30 min，保留时间稳定性 RSD ## Q&A常见问题 PE150 跑一次能产出多少数据？ PE150 模式下读长最高 2×300 bp，单张 flow cell 产出最高 25 B reads，可支持 WGS/WES/RNA-seq/scRNA-seq。 WGS 的数据质量能保证吗，Q30 一般多少？ WGS 的 Q30 比例标准是 ≥ 85%；上机过程中实时监控，低于 80% 会触发预警并评估是否重测。 做长读长测序，你们有哪些机器？ 三代平台有 PacBio Revio / Sequel IIe 和 Oxford Nanopore PromethION 24 / MinION Mk1C。 样本量特别少，还能做蛋白质组吗？ 可以，Bruker timsTOF HT 适合超低上样量（< 100 ng）场景，也用于微量样本和单细胞蛋白质组学。 文库送上机前需要达到什么标准？ 文库浓度需 ≥ 2 nM（Illumina 标准），用 EB 缓冲液稀释；片段分布符合预期、无明显接头二聚体峰，pool 内等摩尔混合并与 flow cell 型号匹配。 需要方案支持？ 免费方案设计与样本评估，1 小时内响应。 联系技术团队 → 电话咨询： 400-660-8826 微信扫码咨询