---
title: "Metagenomics"
lang: ko
url: https://www.gereallife.com/ko/services/metagenomics.html
canonical: https://www.gereallife.com/ko/services/metagenomics.html
entity: Shanghai Gereallife Biotech Co., Ltd
updated: 2026-11-02
---
# 메타지노믹스 시퀀싱

 

Metagenomics

 
 
 
 6 G 시퀀싱 데이터량 SEQUENCING DATA 5 기능 데이터베이스 FUNCTIONAL DATABASES 8 분석 모듈 ANALYSIS MODULES 

## 기술 사양

 TECHNICAL SPECIFICATIONS 

| Item | Details |
| --- | --- |
| Sequencing Data Volume | 6 G / 10G |
| Assembly | Assembly into contigs with MEGAHIT (succinct de Bruijn graph); N50, contig counts and length distributions reported |
| Gene Prediction | Prodigal predicts prokaryotic and metagenomic ORFs, outputting gene sequences, protein sequences and GFF files |
| Non-redundant Gene Set | MMseqs2 clustering at 95% identity and 90% alignment coverage for dereplication; gene abundance quantified by Bowtie2 mapping |
| Taxonomic & Functional Annotation | Taxonomic annotation by DIAMOND against NCBI-NR; functional annotation across five databases — GO, KEGG, COG, CAZy and CARD (including antibiotic resistance ontology ARO) |

 
 

## 분석 프로세스

 ANALYSIS WORKFLOW 1 데이터 QC raw · 정제 데이터 2 어셈블리 MEGAHIT · contig 3 유전자 예측 Prodigal · ORF 4 유전자 세트 구축 MMseqs2 · Bowtie2 5 기능 주석 NR / KEGG / CAZy 6 조성 분석 벤 · 막대 · 히트맵 7 다양성 분석 알파 · 베타 8 차등 분석 LEfSe · 순위합 검정 
 

## 생물정보 분석

 BIOINFORMATIC MODULES 

| Module | Core Methods & Metrics | Key Outputs |
| --- | --- | --- |
| Sequencing Statistics | Raw fastq (R1/R2) statistics: data volume, read counts, base counts, Q20/Q30 and GC content; base retention rate after adapter trimming and quality filtering | Raw and cleaned data statistics tables, base-quality and content distribution plots |
| Assembly | MEGAHIT (succinct de Bruijn graph) assembles effective sequences per sample into contigs; N50, contig counts and length distributions reported | Assembly statistics tables, length distribution plots |
| Gene Prediction | Prodigal predicts prokaryotic and metagenomic ORFs and coding regions, outputting gene sequences, protein sequences and GFF files | Gene sequence files, protein sequence files, GFF |
| Non-redundant Gene Set | MMseqs2 clustering at 95% identity and 90% alignment coverage for dereplication; per-sample effective reads mapped to the gene set with Bowtie2 for abundance | Non-redundant gene set, gene abundance tables |
| Taxonomic & Functional Annotation | DIAMOND against NCBI-NR for taxonomic annotation with abundance computed from domain to species; functional annotation across GO, KEGG, COG, CAZy and CARD (including ARO) | Annotation summary tables, per-database level abundance tables |
| Composition analysis | Venn diagrams, community bar plots and abundance heatmaps at species (Species/Genus/Family, etc.) and function (KO/COG/CAZy/ARO/GO/Pathway) levels | Venn diagram, community bar plots, heatmap |
| Diversity analysis | Alpha-diversity indices with intergroup boxplots; beta-diversity distance matrices, hierarchical clustering, PCA / PCoA / NMDS ordination and ANOSIM tests | Index boxplots, PCA / PCoA / NMDS plots, ANOSIM plots |
| Differential Analysis | LEfSe (LDA) at species and functional levels; intergroup Wilcoxon rank-sum tests to screen differential taxa and functional units | LEfSe plots, LDA bar charts, differential test tables |

 
 

## 결과 예시

 SELECTED FIGURES FROM ACTUAL REPORTS Contig 길이 분포 시료별 어셈블리 contig의 길이 구간 분포로, N50 등 어셈블리 지표를 함께 제시합니다. KEGG 기능 주석 KEGG 2차 계층 경로의 유전자 수로, 대사·유전정보 처리 등 주요 카테고리에 따라 색상으로 구분합니다. CAZy 주석 6개 기능 모듈(GH / GT / PL / CE / AA / CBM)별 유전자 수입니다. 공통 / 고유 종 벤 다이어그램 Treat 그룹과 Con 그룹 간 공통 및 고유 종입니다. 종 조성 막대 그래프(속 수준) 시료별 속 수준 상대 풍부도로, 그룹 간 군집 구조 차이를 시각화합니다. 종 풍부도 히트맵(발췌) 상위 종의 시료별 풍부도 분포와 계층적 클러스터링으로, 일부 종만 표시합니다. PCA(종 수준) 시료 간 조성 차이와 그룹 내 클러스터링을 보여주는 주성분 점수 플롯입니다. PCoA(종 수준, Bray-Curtis) 종 거리 행렬에 대한 주좌표 분석으로, 신뢰 타원은 그룹 구조를 보여줍니다. LEfSe LDA 막대 그래프(발췌) 그룹 간 유의하게 다른 종과 LDA 점수로, 색상으로 그룹을 구분하며 상위 항목만 표시합니다. 
 

## 적용 분야

 APPLICATIONS 
 마이크로바이옴 기능 잠재성 신규 유전자 및 경로 발굴 내성 유전자 및 환경 모니터링 숙주-미생물 상호작용 메타게놈 어셈블리 게놈(MAG) 
 

## FAQ

 FAQ 
 How long does a Metagenomics project take? From sample QC approval, standard timelines are 3-6 weeks (library prep, sequencing and bioinformatics included); large cohorts or deep custom analyses follow the confirmed study plan. What if my samples fail QC? Failed QC is reported immediately with reasons, and we discuss resampling or plan adjustments with you — sequencing never proceeds without qualification. What bioinformatics is included? Can I add custom analyses? Standard delivery covers QC, mapping/assembly, quantification, differential and functional enrichment analyses. Custom deep-dive and multi-omics integrative analyses are supported on request. What samples do you need for Metagenomics? Total RNA ≥1 μg with RIN ≥7 (snap-frozen, dry ice); microbial and faecal samples ≥200 mg (sterile, −80 °C); whole blood for WGS ≥500 μL (EDTA only, never heparin). RNA integrity matters more than concentration. See Technical Resources → Sample Guide . 
 
 

## 관련 서비스

 RELATED SERVICES 
 

### 진핵 RNA-seq

Eukaryotic RNA-seq

 

### 앰플리콘 시퀀싱

Amplicon Sequencing

 

### 전장유전체 시퀀싱

Whole Genome Sequencing

 
 
 

## 멀티오믹스 프로젝트를 시작하세요

 

무상 연구 설계 · 밀착 실행 · 심층 데이터 해석

 
 

HOTLINE 400-660-8826 EMAIL market@gereallife.com 공식 채널 OFFICIAL CHANNELS 공식 계정 WECHAT OFFICIAL ACCOUNT 위챗 고객 서비스 CUSTOMER SERVICE 샤오홍슈 XIAOHONGSHU 납기 안내: 시료 운송, 통관 신고 등의 사유로 납기가 연장될 수 있으며, 실제 프로젝트 일정을 기준으로 합니다.

 
 
 
 

## 견적 및 실험 설계 요청

요청을 남겨주시면 1영업일 이내에 회신드립니다 (무료 검토)

 
 
 
 성함 
 소속 
 
 휴대폰 또는 위챗 
 관심 서비스 
 시료 유형, 수량, 목표 (선택) 
 
 제출 
 상담 목적으로만 사용되며 외부에 공유되지 않습니다. 
 
 
 
 
 

 
 

## Start Your Multi-omics Project

 

Free study design · Interactive execution · In-depth data interpretation

 
 HOTLINE 400-660-8826 
 EMAIL market@gereallife.com 
 
 
 Official Channels 
 OFFICIAL CHANNELS 
 
 Official Account WECHAT OFFICIAL ACCOUNT 
 WeChat Service CUSTOMER SERVICE 
 Xiaohongshu XIAOHONGSHU 
 
 
 

 
 Call us： 400-660-8826 
 Scan to chat on WeChat